Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX2P52951 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBX2P52951 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX2P52951 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX2P52951 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX2P52951 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX2P52951 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX2P52951 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX2P52951 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX2P52951 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX2P52951 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX2P52951 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX2P52951 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX2P52951 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX2P52951 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX2P52951 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX2P52951 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX2P52951 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX2P52951 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX2P52951 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX2P52951 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX2P52951 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBX2P52951 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBX2P52951 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBX2P52951 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBX2P52951 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBX2P52951 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBX2P52951 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBX2P52951 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms