Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN1BP46527 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN1BP46527 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKN1BP46527 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms