Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	WHI2	YOR043W	1461 nt		5.46	□□□□□ -1.53
SHE2	P36068	ERG8	YMR220W	1356 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	RPN11	YFR004W	921 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	RPL10	YLR075W	666 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YNR040W	YNR040W	771 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	KEX2	YNL238W	2445 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	PLB3	YOL011W	2061 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	HST3	YOR025W	1344 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	AMA1	YGR225W	1782 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	FRS2	YFL022C	1512 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	PTK2	YJR059W	2457 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	RAD59	YDL059C	717 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	TSR2	YLR435W	618 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	UIP5	YKR044W	1332 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	SAC6	YDR129C	1929 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	GAT1	YFL021W	1533 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	CYS4	YGR155W	1524 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	CLB1	YGR108W	1416 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	SKN1	YGR143W	2316 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	SGF29	YCL010C	780 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	QNS1	YHR074W	2145 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	ZWF1	YNL241C	1518 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	ALD6	YPL061W	1503 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YIL077C	YIL077C	963 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YHM2	YMR241W	945 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	RRS1	YOR294W	612 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YFR006W	YFR006W	1608 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YMR279C	YMR279C	1623 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	AAT2	YLR027C	1257 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	TSA1	YML028W	591 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	GLC8	YMR311C	690 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	PUS4	YNL292W	1212 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	ECM14	YHR132C	1293 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YOL131W	YOL131W	327 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	ACC1	YNR016C	6702 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	ATF1	YOR377W	1578 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	URA1	YKL216W	945 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	TAL1	YLR354C	1008 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	YBR027C	YBR027C	333 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	ATP4	YPL078C	735 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SHE2	P36068	BZZ1	YHR114W	1902 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	RAD3	YER171W	2337 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	HIR1	YBL008W	2523 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	LSG1	YGL099W	1923 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YEL068C	YEL068C	333 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	LDS1	YAL018C	978 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	GFA1	YKL104C	2154 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	XBP1	YIL101C	1944 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	SDH4	YDR178W	546 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	CHO1	YER026C	831 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	HAP2	YGL237C	798 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	FSF1	YOR271C	984 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	CRF1	YDR223W	1404 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	STE13	YOR219C	2796 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	GUA1	YMR217W	1578 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	HSP78	YDR258C	2436 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YJU3	YKL094W	942 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	MRPS16	YPL013C	366 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YPR114W	YPR114W	948 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	EHD3	YDR036C	1503 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YKR023W	YKR023W	1593 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	NSE5	YML023C	1671 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	ATP1	YBL099W	1638 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	NHA1	YLR138W	2958 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	POX1	YGL205W	2247 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	RVB2	YPL235W	1416 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	CDC34	YDR054C	888 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YER186C	YER186C	921 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	HSP150	YJL159W	1242 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	ILV6	YCL009C	930 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	PYC1	YGL062W	3537 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	YPK2	YMR104C	2034 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	CUP2	YGL166W	678 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	RME1	YGR044C	903 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SHE2	P36068	MDM31	YHR194W	1740 nt		5.34	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	MCM3	YEL032W	2916 nt		5.34	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	SCS7	YMR272C	1155 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	COS10	YNR075W	1125 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	YEH1	YLL012W	1722 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	ATG4	YNL223W	1485 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	ERC1	YHR032W	1746 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	IDP1	YDL066W	1287 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	RPS2	YGL123W	765 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	GPB2	YAL056W	2643 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	TNA1	YGR260W	1605 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	PCS60	YBR222C	1632 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	YDL057W	YDL057W	987 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	YET3	YDL072C	612 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	NAS6	YGR232W	687 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SHE2	P36068	PSR2	YLR019W	1194 nt		5.31	□□□□□ -1.56

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