Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP214P35658 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP214P35658 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP214P35658 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP214P35658 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP214P35658 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP214P35658 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP214P35658 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP214P35658 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP214P35658 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP214P35658 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP214P35658 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP214P35658 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP214P35658 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP214P35658 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP214P35658 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP214P35658 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP214P35658 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP214P35658 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP214P35658 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP214P35658 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP214P35658 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP214P35658 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP214P35658 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP214P35658 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP214P35658 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP214P35658 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP214P35658 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP214P35658 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP214P35658 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP214P35658 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP214P35658 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP214P35658 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP214P35658 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP214P35658 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP214P35658 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP214P35658 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP214P35658 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP214P35658 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP214P35658 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP214P35658 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP214P35658 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP214P35658 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms