Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms