Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMLP26374 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMLP26374 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMLP26374 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMLP26374 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMLP26374 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMLP26374 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMLP26374 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMLP26374 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMLP26374 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMLP26374 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMLP26374 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMLP26374 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMLP26374 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMLP26374 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMLP26374 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMLP26374 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMLP26374 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMLP26374 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMLP26374 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMLP26374 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMLP26374 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMLP26374 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMLP26374 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMLP26374 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMLP26374 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMLP26374 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMLP26374 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMLP26374 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMLP26374 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMLP26374 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMLP26374 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMLP26374 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMLP26374 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMLP26374 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMLP26374 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMLP26374 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMLP26374 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMLP26374 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMLP26374 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMLP26374 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMLP26374 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMLP26374 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMLP26374 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMLP26374 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHMLP26374 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHMLP26374 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMLP26374 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMLP26374 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMLP26374 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMLP26374 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMLP26374 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMLP26374 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMLP26374 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMLP26374 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMLP26374 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMLP26374 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMLP26374 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMLP26374 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMLP26374 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMLP26374 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMLP26374 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMLP26374 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMLP26374 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMLP26374 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMLP26374 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMLP26374 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMLP26374 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMLP26374 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMLP26374 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMLP26374 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMLP26374 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms