Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ESRRAP11474 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms