Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF21O75509 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms