Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf118A6NHY6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf118A6NHY6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms