Protein–RNA interactions for Protein: A5X5Y0

HTR3E, 5-hydroxytryptamine receptor 3E, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3EA5X5Y0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR3EA5X5Y0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3EA5X5Y0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3EA5X5Y0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR3EA5X5Y0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms