Protein–RNA interactions for Protein: A1A580

KRTAP23-1, Keratin-associated protein 23-1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP23-1A1A580 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP23-1A1A580 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms