Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms