Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLCO3A1Q9UIG8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO3A1Q9UIG8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO3A1Q9UIG8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO3A1Q9UIG8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms