Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
REEP4Q9H6H4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
REEP4Q9H6H4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms