Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP44Q9C0F1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms