Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms