Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2Q9BX26 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2Q9BX26 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms