Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TIMM29Q9BSF4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM29Q9BSF4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms