Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FYCO1Q9BQS8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
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