Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms