Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIN3AQ96ST3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms