Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms