Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms