Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms