Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHF3Q92576 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms