Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms