Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARMIL3Q8ND23 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CARMIL3Q8ND23 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms