Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IKBIPQ70UQ0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms