Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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