Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 STAG1-207ENST00000483235 5206 ntTSL 1 (best)8.39□□□□□ -1.079e-8■■■■■ 29.1
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PRPF8Q6P2Q9 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.089e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.099e-8■■■■■ 29.1
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PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.649e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 RUFY1-211ENST00000508609 812 ntTSL 54.78□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.659e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 NSUN6-208ENST00000607346 553 ntTSL 44.71□□□□□ -1.669e-8■■■■■ 29.1
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PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.689e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 NSUN6-207ENST00000606425 578 ntTSL 44.58□□□□□ -1.689e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 CCDC18-AS1-211ENST00000438777 752 ntTSL 34.57□□□□□ -1.689e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 E2F5-205ENST00000518234 674 ntTSL 54.55□□□□□ -1.689e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.689e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 WNK1-211ENST00000540360 668 ntTSL 24.44□□□□□ -1.79e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 UBXN7-203ENST00000413584 374 ntTSL 54.44□□□□□ -1.79e-8■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 FKBP4-202ENST00000538622 572 ntTSL 54.29□□□□□ -1.722e-14■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 DIS3L2-214ENST00000464554 585 ntTSL 54.22□□□□□ -1.732e-14■■■■■ 29.1
PRPF8Q6P2Q9 MIOS-208ENST00000479694 2888 ntTSL 24.15□□□□□ -1.759e-8■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1564.4 ms