Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms