Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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