Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GEN1Q17RS7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GEN1Q17RS7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GEN1Q17RS7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GEN1Q17RS7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GEN1Q17RS7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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