Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYT16Q17RD7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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