Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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