Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA2Q15560 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCEA2Q15560 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms