Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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