Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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