Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NBR1Q14596 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NBR1Q14596 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NBR1Q14596 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NBR1Q14596 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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NBR1Q14596 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NBR1Q14596 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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