Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIDRQ14159 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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