Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBFBQ13951 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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