Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms