Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CUL4AQ13619 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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