Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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