Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLAMF1Q13291 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLAMF1Q13291 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms