Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms