Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN2AQ12879 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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