Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms