Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA3Q08378 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms