Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms